Anbei einmal das wesentliche:
Zuerst die includes:

#include "stdafx.h"
#include <iomanip> 
#include <iostream>
#include <time.h>
#include <math.h>
#include <matrix.h>
#include <stanzMatrix.h>
#include <vector>
#include <string>
#include <cstdlib> // für exit( )
#include <fstream>

Nun die Ausleseprozedur

bool debug_Ausgabe;
bool graphen;
int maxAnzahlErzeugendeElemente;

bool dateiAuslesen()
  {
    // Definieren und Öffnen der Eingangsdatei
    int ersteStelle;
    int zweiteStelle;
    char buf[100];

    ifstream Quelle;            // Datentyp für Eingabestrom (s.o.)
    string Quelldateiname;
    Quelldateiname = "proggy.ini";
    //Quelle.open(Quelldateiname.c_str(),ios::in|ios::out);// Datei öffnen:
    //Quelle.open(Quelldateiname.c_str(),ios::binary|ios::out);// Datei öffnen:
    Quelle.open(Quelldateiname.c_str());// Datei öffnen:

    if (!Quelle)     // Fehlerabfrage
      {
          cerr << Quelldateiname
               << " kann nicht geöffnet werden!\n";
          exit(-1);
      }
    //Graphen oder Ordnungen / Topologien
    Quelle.getline(buf, 10);
    graphen = (buf[0] == 0);
    // nur zum debuggen:
    graphen ? cout << "ja\n" : cout << "nein\n";
    //Graphen oder Ordnungen / Topologien
    Quelle.getline(buf, 20);
    ersteStelle = (int) buf[0];
    zweiteStelle = (int) buf[1];
    maxAnzahlErzeugendeElemente = (10*ersteStelle) + zweiteStelle;

    //Graphen oder Ordnungen / Topologien
    Quelle.getline(buf, 10);
    debug_Ausgabe = (buf[0] == 0);
    // nur zum debuggen:
    debug_Ausgabe ? cout << "ja\n" : cout << "nein\n";
    return true;
  }

und die auszulesende Datei proggy.ini:

0  // 0 steht für Graphen, 1 steht für Ordnungen/Topologien
11 // dies ist die Anzahl der erzeugenden Elemente
0  // 0 steht für keine DebugAusgaben, 1 steht für DebugAusgaben.

Wie gesagt, zuerst soll er Null oder Eins auslesen, dann eine zweistellige Zahl, und zum Schluss wieder Null oder Eins.
Leider klappt das nicht
Any ideas?

Dann kannst du dir das buffer rumgehampel sparen.

Wieso benutzt du nicht getline, liest in einen std::string und zerlegst diesen dann substr, find etc?

Dann kannst du dir das buffer rumgehampel sparen.

... weil ich diese Option bislang noch nicht kannte.
Aber DAS war der Tip, nun funzt es.
Danke!