#include<iostream>
using namespace std;

int main()
{
    int a;
    int b;
    int c;
    int d;
    int e;
    int f;

    int array[]={1,2,3,4,5,6};

    srand(time(NULL));  //rand() erzeugt nur Pseudo-Zufallszahlen.
                        //Hier setze ich den Start-Wert von rand()
                        //Auf die aktuelle Zeit.

    a=rand() % 6 + 1;  //der Modulo-Operator % Gibt den Rest einer
                           //Ganzzahlen-Division zurück.
                           //Man teile(modulo) rand() durch 4 und addiere
                           //1, schon bekommt man ein Zahl von 1-4.

    b = array[1+(rand() % 1)];
    c = array[2+(rand() % 1)];
    d = array[3+(rand() % 1)];
    e = array[4+(rand() % 1)];
    f = array[5+(rand() % 1)];
    cout<<a;
    cout<<"\n";
    cout<<b;
    cout<<"\n";
    cout<<c;
    cout<<"\n";
    cout<<d;
    cout<<"\n";
    cout<<e;
    cout<<"\n";
    cout<<f;
    cout<<"\n";

    cin.get();

}

rand()%1 liefert immer 0.

versteh nicht so recht, warum du für a eine zufallszahl zwischen 1 und 6 "ziehst" und die restlichen 5 werte mit werten aus einem vordefinierten array belegst.

unsigned int lottozahlen[ 49 ]; 
size_t size = sizeof( lottozahlen ) / sizeof( unsigned int );

for( int i = 0; i < size; ++i )
 lottozahlen[ i ] = i + 1;

//Zufallsgenerator initialisieren
srand( time( 0 ) );

//Jetzt wird gemischt
random_shuffle( lottozahlen, lottozahlen + size );

//Zahlen ausgeben
copy( lottozahlen, lottozahlen + 6, ostream_iterator< unsigned int >( cout, ' ' ) );

Edit:

Als Header benötigst du <algorithm>.

eine idee wäre, dass du die erste zahl mit rand()%6 aus dem array "ziehst" und es anschliessend um 1 "verringerst". die nächste zahl ziehst du mit rand()%5 usw.