habe wieder mal ein Problem. Ich will, dass im String xxx mehrere Überprüfungen stattfinden. Beispiel:

string::iterator i;
   for(i=mRNA.begin();i!=mRNA.end();++i)
{
           if(*i = 'UUU' || 'UUC')
           *i='Phe';
           ++i;
           if(*i = 'UGU' || 'UGC')
           *i='Cys';
           ++i;
}

usw. Da sollen noch 5 weitere Überprüfungen kommen. Mir ist schon klar dass das da oben nicht richtig ist, aber wollte nachfragen ob jemand vllt eine Lösung weiß.

Danke, König Engluish

Zum anderen: Ein Iterator repräsentiert *ein* Element i String, also ein 'char'. Deine Elemente sind Strings. Du brauchst dementsprechend (um gleich mal die Fachterminologie zu verwenden) ein sliding window.

Folgender Code ist nicht besonders effizient (es finden Kopier-Operationen statt), sollte aber so klappen:

stringstream peptide;
for(string::iterator i = mRNA.begin(); i != mRNA.end(); i += 3) {
    string window(i, i + 3);
    if (window == "UUU" or window == "UUC")
        peptide << "Phe"; // oder, IMHO besser: peptide << 'F' ...
    // ... etc.
}

Dazu sei aber gesagt, dass ich hier eher eine map<string, string> verwenden würde, da Du ja wahrscheinlich die gesamte AA-Tabelle durchgehen willst.

/EDIT: Schrittweite der Schleife korrigiert.

stringstream sa; 
for(string::iterator i = mRNA.begin(); i != mRNA.end(); ++i) { 
    string window(i, i + 3); 
    if (window == "UUU" || window == "UUC") 
        sa << "Phe"; 
}
cout<<sa;

Es müsste ja eigentlich gehen, jedoch wird mir am Schluss nichts angezeigt?
P.S. Es muss noch <sstream> eingefügt werden

König Engluish

Es müsste ja eigentlich gehen, jedoch wird mir am Schluss nichts angezeigt?

versuch mal "cout << sa.str();".

Übrigens kann man sich die Kopie sparen, wenn man das Fenster nicht explizit erstellt und zum Vergleich die Funktio 'std::equal' aus <algorithm> verwendet:

stringstream sa;
for(string::iterator i = mRNA.begin(); i != mRNA.end(); i += 3) {
    if (equal(i, i + 3, "UUU") || equal(i, i + 3, "UUC"))
        sa << "Phe";
}
cout << sa.str();

Gäbe es denn evt. noch weitere Möglichkeiten?

König Engluish

Es will einfach nicht bei mir funktionieren..

Was funktioniert nicht? Welcher Fehler kommt?

König Engluish

Beim Compilieren geht alles, wenn ich es ausführe kommt... NICHTS einfach gar nichts..

Ok, pack noch ein 'flush' hinter die Ausgabe, oder ein 'endl'.

Oder schließt sich die Konsole etwa? Da gibt's ne FAQ drüber, man kann das Schließen verhindern:

void wait() // Ungetestet, aus dem Gedächtnis.
{
    using std::cin;
    cin.clear();
    cin.ignore(cin.rdbuf()->in_avail());
    cin.get();
}

Diese Funktion dann halt nach der Ausgabe in 'main' aufrufen.

König Engluish

int laenge=mRNA.length();

    char puffer[laenge];

    for(int i=0;i<laenge/3;i=i+3)
    {
            mRNA.copy(puffer,i);

    }

Ich will, dass der Puffer nach und nach überprüft wird, nach den Kombinationen und dann die Lösungen an mRNA anhängt. Wäre das realisierbar ?

Zweitens: Wieso willst Du das Ergebnis an die RNS anhängen? Das scheint keinen Sinn zu ergeben.

Drittens: Iteratoren kann man hier leider nicht verwenden, da man den String ja verändert.

Viertens: So.

string::size_type len = mRNA.length();
for (string::size_type i = 0; i < len; i += 3) {
    string::const_iterator it = mRNA.begin() + i;
    if (equal(it, it + 3, "UUC") or equal(it, it + 3, "UUU"))
        mRNA += "Phe";
    // usw. usf.
}

Aber wie gesagt: Was soll das bringen?

mRNA += "Phe";

lol? nicht aufgepasst in bio?

mRNA += "Phe";

lol? nicht aufgepasst in bio?

Äh, lies Dir den ganzen Thread (oder auch nur das gesamte Posting, insbesondere den Satz "Das scheint keinen Sinn zu ergeben.") durch, bevor Du klugscheißt. Mir ist der Unterschied zwischen Peptid- und Phosphodiesterbindung durchaus bewusst.