while (!dateiname.eof())
{
input >> x >> y;

... aber ich muss zuvor noch angaben machen wie viele koordinaten ich habe.

Das verstehe ich nicht so ganz. Es würde helfen wenn du etwas mehr Code posten würdest, denn bis jetzt sieht es für mich so aus als würdest du das ganze vermutlich mit dem Code aus diesem Thread hier machen:
http://www.c-plusplus.net/forum/viewtopic-var-t-is-227230-and-start-is-0.html
Sollte ich mit dieser Vermutung tatsächlich ins Schwarze getroffen haben, dann würde ich dir jetzt schonmal raten statt mit Arrays lieber mit std::vector zu arbeiten, so wie ich es auch schon in den eingangs erwähnten Thread geraten hatte. Und falls ich doch total daneben liegen sollte, dann poste bitte etwas mehr Code :).

char dateiname[40];
ifstream input(dateiname);
while (!dateiname.eof()) {
input >> x >> y;

hier will ich dann die werte direkt in der schleife verwenden, dann brauche ich kein array.
und sobald die zahlen in der datei zu ende sind soll die whilschleife beendet werden

...hier will ich dann die werte direkt in der schleife verwenden, dann brauche ich kein array.
und sobald die zahlen in der datei zu ende sind soll die whilschleife beendet werden

Dann Probiers mal so:

while (input >> x >> y) {
/* x und y verarbeiten */
}

Hier wird das Einlesen aus der Datei als Bedingung der while -Schleife verwendet, was bedeutet, dass wenn es nichts mehr einzulesen gibt, dass dann die while -Schleife verlassen wird.

while (!input.eof()) {

Argh, jetzt erst sehe ich das methin das char -Array und nicht das ifstream -Objekt in der Bedingung der while -Schleife verwendet. Oh man, hab ich heute Tomaten auf den Augen .

ifstream input(Dateiname);

ein, er will nun nicht die Anzahl der Koordinaten in der Text Datei angeben sonder, das das Programm aufhört die Dateien einzulesen wenn keine mehr vorhabend sind.
Hoff ich hab das ganz so einigermaßen gut ausgedrückt