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Der war durchaus ernst gemeint, Änderungen an den Projektoptionen werden nun mal nur beim Speichern des Projektes gesichert. Und es besteht ja die theoretische Möglichkeit, dass du das, aus welchem Grund auch immer, versäumt hast.
Deiner entrüsteten Reaktion entnehme ich, dass das bei dir nicht zutrifft. Du solltest also untersuchen, ob die Änderungen auch tatsächlich in der Projektdatei (bpr) auftauchen.