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Das BIOS ist letztendlich auch nur eine (Treiber-)Software. Die kann einzelne Geräte aktivieren, oder es bleiben lassen. Offenbar ignoriert es dabei die Sound-Hardware, bzw. funktioniert fehlerhaft.
Letztendlich muessen um das zu pruefen vom BIOS evtl. hinterlassene Tabellen/Einstellungen ignoriert oder ergaenzt werden.
In diesem Fall waere das wohl der PnP-Teil, bzw. das PCI-BIOS. Keine Ahnung, wie man dem Kernel klar macht, diese BIOS-Teile nicht zu benutzen - koennte aber helfen (Knoppix Start-Optionen?).
Wenn der Linux-Treiber ansonsten nachträglich nicht in der Lage ist, die Hardware zu aktivieren, liegt dort eindeutig das Problem.
Du koenntest dann also versuchen, dich mit den Entwicklern kurz zu schliessen, oder du wartest eben weiter, bis es jemand anders tut, bzw. ihnen per Zufall etwas mit deiner Hardware Vergleichbares in die Finger geraet.